Meta AI stworzyła konkurenta dla DeepMind AlphaFold

ikona publikacji - ciemny
Opublikowano: 3 listopada 2022
ikona autora biały
meta ai białka

Naukowcy z Meta AI udostępnili "model języka białkowego" ESM-2 z 15 miliardami parametrów oraz bazę ESM Metagenomic Atlas z ponad 600 milionami metagenomicznych struktur predykcyjnych.

Białka są złożonymi cząsteczkami składającymi się nawet z 20 rodzajów aminokwasów i pełnią w organizmach wszelkie funkcje biologiczne. Są one składane w złożone trójwymiarowe struktury, których kształt bezpośrednio wpływa na sposób ich działania.

Określenie rodzaju związku pozwala naukowcom zrozumieć, jak funkcjonują białka. Ponadto dane o kształcie pomagają im znaleźć sposoby naśladowania, modyfikowania lub przeciwdziałania tym zachowaniom.

Nie można wziąć wzorów aminokwasów i od razu określić ostatecznej struktury, a symulacje i eksperymenty są czasochłonne.

Meta AI powiedziała, że sieć neuronowa ESM-2 to duży model językowy zaprojektowany do "badania wzorców ewolucyjnych i tworzenia dokładnych przewidywań związków bezpośrednio z sekwencji białka".

meta ai
źródło: Meta AI

System przetwarza sekwencje genów wykorzystując technikę samouczenia zwaną maskowanym modelowaniem języka.

Naukowcy twierdzą, że wytrenowali algorytm na tablicy sekwencji milionów naturalnych białek. W dokumencie możemy przeczytać:

W tym podejściu model musi poprawnie uzupełnić słowa we fragmencie tekstu, np. 'To __ or not , that is '. Wyszkoliliśmy model językowy, aby wypełnić luki w sekwencjach białek, takich jak 'GL_KKE_AHY_G' wśród milionów różnych związków.

źródło: Meta AI

ESM-2 - co to?

ESM-2 jest największą i najbardziej wydajną siecią neuronową tego typu. Według naukowców algorytm jest 60 razy szybszy niż inne zaawansowane systemy, takie jak AlphaFold firmy DeepMind.

Algorytm pomógł zbudować Atlas Metagenomiczny ESM, przewidując 617 milionów struktur z bazy danych białek MGnify90 w ciągu zaledwie dwóch tygodni na klastrze złożonym z 2000 jednostek GPU. Symulacja związku składającego się z 384 aminokwasów zajęłaby 14,2 sekundy na jednej karcie graficznej Nvidia V100.

Przy dzisiejszych narzędziach obliczeniowych przewidywanie struktury setek milionów białek może zająć lata. Nawet przy wykorzystaniu zasobów dużej instytucji badawczej. Aby dokonywać predykcji w skali metagenomiki, przełom w szybkości przewidywania jest krytyczny.

Meta AI ma nadzieję, że ESM-2 i Atlas Metagenomiczny ESM przyczynią się do rozwoju nauki i pomogą ekspertom badającym historię ewolucji lub zwalczającym choroby i zmiany klimatyczne. Naukowcy dodają:

Badamy również sposoby zastosowania modeli językowych do opracowania nowych białek i pomocy w rozwiązywaniu problemów zdrowotnych i środowiskowych.

Przypomnijmy, że w lipcu algorytm AlphaFold firmy DeepMind przewidywał niemal każdy znany nauce związek występujący w roślinach, bakteriach i zwierzętach.

W tym samym miesiącu naukowcy z MIT opracowali EquiBind, model głębokiego uczenia, który łączy cząsteczki z białkami w tworzeniu leków 1200 razy szybciej niż jego odpowiedniki.

W lipcu 2021 roku sztuczna inteligencja z DeepMind wymodelowała 20 tysięcy struktur ludzkich białek.

Kategoria wpisu:

Podobne tematy

Sztuczna inteligencja w samochodach może zapobiec korkom ulicznym

Zespół naukowców odkrył, że tempomat wyposażony w sztuczną inteligencję może pomóc w likwidacji korków na ulicach. W pięciodniowym eksperymencie na I-24 w Nashville w stanie Tennessee w USA wzięło udział 100 samochodów kierowanych przez ludzi. Każdy z nich wyposażony był w system tempomatów ze sztuczną inteligencją. Zespół zastosował dwa algorytmy: "planista prędkości" i "kontroler". Oba […]

Wielka Brytania uznaje porno deepfake za przestępstwo

Władze Wielkiej Brytanii rozpatrzą projekt ustawy zakazującej rozpowszechniania materiałów o wyraźnym zabarwieniu i deepfake porno bez zgody osób na nich przedstawionych. Taką informację podaje The Guardian. The Guardian donosi, że zdjęcia o charakterze seksualnym wykonane bez zgody za pomocą ukrytych kamer będą karalne. Zdelegalizowałaby również "whistleblowing" - rozpowszechnianie osobistych zdjęć w ramach zemsty. Zgodnie z […]

USA wezwały do wpisania samochodów-robotów na listę zagrożeń narodowych

Amerykańscy kongresmani zostali poproszeni o sprawdzenie importowanej z Chin technologii jazdy bezzałogowej pod kątem zagrożeń dla bezpieczeństwa narodowego. Takie informacje podaje Wired. Członek Izby Reprezentantów USA z Partii Republikańskiej, August Pflüger, wysłał do NHTSA odpowiedni list. Kongresman poprosił regulatora o odpowiedź na szereg pytań związanych z prześwietlaniem zagrożeń dla bezpieczeństwa narodowego przez chińskie firmy. Pozostaję […]

Konkurent Neuralink stworzył implant neuronowy do leczenia ślepoty

Firma Science, należąca do współzałożyciela Neuralink, Maxa Hodaka, zaprezentowała Science Eye, neuro-interfejs do leczenia chorób oczu, które wywołują ślepotę. Start-up skupia się na fotonice. Specjaliści firmy nie wszczepiają chipów głęboko do mózgu, jak robi to Neuralink, ale wykorzystują światło i nerw wzrokowy oka. Science Eye to cienka, szeroka na 2 mm folia LED, która jest […]

Flywire osiąga rekordowe przychody w III kwartale 2022 r.

Flywire, notowana na Nasdaq firma zajmująca się umożliwieniem i obsługą międzynarodowych płatności, podała wczoraj swoje wyniki finansowe za trzeci kwartał 2022 roku. W ciągu trzech miesięcy zakończonych 30 września 2022 r. przychody Flywire osiągnęły 95,2 mln USD, co oznacza wzrost o 40% w porównaniu z 67,8 mln USD w tym samym okresie ubiegłego roku. Całkowity […]
0 0 Głosy
Oceń artykuł
guest
0 komentarzy
Inline Feedbacks
View all comments
© FintechPortal.pl 2021 Wszelkie prawa zastrzeżone
star